Brain Transcriptome Database (BrainTx)
トランスクリプトームデータ
CD29698
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/TranscriptomeData/CD29698
CD29698(トランスクリプトームデータ)
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CD29698
トランスクリプトームデータ
遺伝子シンボル
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/geneSymbol
Snrnp48
遺伝子名
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/geneName
small nuclear ribonucleoprotein 48 (U11/U12)
別名
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/alt_name
U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 48 kDa protein
small nuclear ribonucleoprotein 48 (U11/U12)
U11/U12 snRNP 48 kDa protein
別名略称
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/alt_symbol
C6orf151
6530403A03Rik
1110050F08Rik
NCBI遺伝子
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/NCBIGene
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/67797
MGI遺伝子
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/mgiGene
small nuclear ribonucleoprotein 48 (U11/U12)
http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/MGI:1915047
BrainTx遺伝子
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/brainTxGene
脳発現画像
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/brainExpressionImage
時系列発現 (小脳)
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/brainExpression
脳発現特異性/組織別発現
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/brainSpecificity
BrainTx遺伝子カテゴリー
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/brainTxGeneCategory
NCBI Accession Number
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/NCBIAccessionNumber
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_026382
Ensembl 遺伝子
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/ensemblGene
http://asia.ensembl.org/Mus_musculus/Gene/Summary?g=ENSMUSG00000021431
UniGene 遺伝子
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/uniGene
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/unigene/?term=Mm.250783
OMIM ID
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/omim
PubMed ID (PMID)
http://rdf.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
Doug. Stryke, et.al., BayGenomics: a resource of insertional mutations in mouse embryonic stem cells., Nucleic acids research, 2003, 31
http://rdf.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12520002
Janne J. Turunen, et.al., The U11-48K protein contacts the 5' splice site of U12-type introns and the U11-59K protein., Molecular and cellular biology, 2008, 28
http://rdf.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18347052
Graciana. Diez-Roux, et.al., A high-resolution anatomical atlas of the transcriptome in the mouse embryo., PLoS biology, 2011, 9
http://rdf.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21267068
Gene Ontology
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/golink
metal ion binding
http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0046872
spliceosomal complex
http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0005681
nucleus
http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0005634
U12-type spliceosomal complex
http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0005689
mRNA processing
http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0006397
cytoplasm
http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0005737
RNA splicing
http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0008380
InterPro ID
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/interPro
KEGG Pathway ID
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/keggPathwayID
KEGG Pathway 名称
http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/keggPathwayName
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