Neuraminidase Structure DB

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Neuraminidase Structure DB

データベース一覧

名称

http://purl.org/dc/terms/title

• Neuraminidase Structure DB

別称

http://purl.org/dc/terms/alternative

ホームページ

http://xmlns.com/foaf/0.1/page

• http://protein.gsc.riken.jp/jp/Research/index_na.html

メタデータへのリンク

http://metadb.riken.jp/db/DBcatalog/metadata_link

運用組織/センター

http://purl.org/dc/elements/1.1/publisher

• 理化学研究所
  http://metadb.riken.jp/db/DBcatalog/Organization/riken
• 主任研究員研究室
  http://metadb.riken.jp/db/DBcatalog/Organization/riken_labs_chief

説明

http://purl.org/dc/terms/description

• 抗インフルエンザウイルス薬開発において第1の標的タンパク質とされる、ノイラミニダーゼの立体構造予測モデル情報を格納しています。構造予測は、ホモロジーモデリング法に基づく立体構造予測のソフトウエアFAMS（ファムス）を用いました。インフルエンザウイルスの増殖にはウイルス由来のノイラミニダーゼと呼ばれるタンパク質が必須であり、特に全世界での新型インフルエンザの流行の可能性という緊急性から、その情報を全て公開することにしました。ノイラミニダーゼは9種類（N1～N9）の亜型に分類されますが、データベースには全種類含まれており、立体構造モデル数は1603件です。

言語

http://purl.org/dc/terms/language

• 日本語
  http://lexvo.org/id/iso639-3/jpn
• 英語
  http://lexvo.org/id/iso639-3/eng

生物種

http://www.w3.org/ns/dcat#organism

• Influenza A virus
  http://purl.obolibrary.org/obo/NCBITaxon_11320
• Influenza B virus
  http://purl.obolibrary.org/obo/NCBITaxon_11520

対象

http://xmlns.com/foaf/0.1/primaryTopic

• タンパク／プロテオーム
  http://metadb.riken.jp/db/DBcatalog/BioTarget/protein

データ種

http://www.w3.org/ns/dcat#theme

• 構造
  http://metadb.riken.jp/db/DBcatalog/BioDataType/Structure

関連論文

http://purl.org/net/cito/citesAsAuthority

• Mayuko. Takeda-Shitaka, et.al., Protein structure prediction in CASP6 using CHIMERA and FAMS., Proteins, 2005, 61 Suppl 7
  http://rdf.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16187353