chemokine (C-X-C motif) ligand 5

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/MGI:1096868

chemokine (C-X-C motif) ligand 5

MGIマーカー

MGIマーカー

http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#label

• chemokine (C-X-C motif) ligand 5

シノニム

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/Marker_Synonyms

• LIX
• Scyb5|granulocyte chemotactic protein-2|Scyb6|Cxcl6|AMCF-II|ENA-78|LIX|GCP-2
• ENA-78
• Cxcl6
• granulocyte chemotactic protein-2
• GCP-2
• Scyb5
• Scyb6
• AMCF-II

シンボル

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/Marker_Symbol

• Cxcl5

MGI Accession ID

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/MGI_ID

• MGI:1096868

染色体

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/MouseChromosome

• Chromosome 5
  http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/mouse_chromosome_5

位置（遺伝的距離）

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/cM_Position

• [44.78 centi morgan]

genetic mapping procedure

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/genetic_mapping_procedure

• genetic mapping

genome coordinate start

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/genome_coordinate_start

• [90759360 megabasepair]

genome coordinate end

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/genome_coordinate_end

• [90761624 megabasepair]

strand

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/strand

• +

Status

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/Status

• O

Marker Type

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/Marker_Type

• Gene

Feature Type

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/Feature_Type

• protein coding gene

See also (jump to original page)

http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#seeAlso

• http://identifiers.org/mgd/MGI:1096868

allele

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/variant_of

• Cxcl5<tm1Gscw>
  http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/MGI:4819800
• Cxcl5<em1Krb>
  http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/MGI:5800577
• Cxcl5<tm1.1Mkch>
  http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/MGI:5565192

表現型アノテーション

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/variant_of

• decreased neutrophil cell number_Cxcl5<tm1.1Mkch>/Cxcl5<tm1.1Mkch>
  http://metadb.riken.jp/0000222B6129P2Cxcl5tm11MkchCxcl5tm11MkchCxcl5tm11MkchCxcl5tm11Mkch
• abnormal circulating chemokine level_Cxcl5<tm1Gscw>/Cxcl5<tm1Gscw>,Ackr1<tm1Scp>/Ackr1<tm1Scp>
  http://metadb.riken.jp/0010209I129Sv129P2OlaHsdC57BL6Cxcl5tm1GscwCxcl5tm1GscwAckr1tm1ScpAckr1tm1ScpAckr1tm1ScpCxcl5tm1Gscw
• decreased interleukin-1 alpha secretion_Cxcl5<tm1.1Mkch>/Cxcl5<tm1.1Mkch>
  http://metadb.riken.jp/0008655B6129P2Cxcl5tm11MkchCxcl5tm11MkchCxcl5tm11MkchCxcl5tm11Mkch
• abnormal circulating chemokine level_Cxcl5<tm1Gscw>/Cxcl5<tm1Gscw>
  http://metadb.riken.jp/0010209I129SvCxcl5tm1GscwCxcl5tm1GscwCxcl5tm1Gscw
• decreased tumor necrosis factor secretion_Cxcl5<tm1.1Mkch>/Cxcl5<tm1.1Mkch>
  http://metadb.riken.jp/0008561B6129P2Cxcl5tm11MkchCxcl5tm11MkchCxcl5tm11MkchCxcl5tm11Mkch
• decreased interleukin-6 secretion_Cxcl5<tm1.1Mkch>/Cxcl5<tm1.1Mkch>
  http://metadb.riken.jp/0008706B6129P2Cxcl5tm11MkchCxcl5tm11MkchCxcl5tm11MkchCxcl5tm11Mkch
• decreased susceptibility to bacterial infection induced morbidity/mortality_Cxcl5<tm1Gscw>/Cxcl5<tm1Gscw>
  http://metadb.riken.jp/0009789I129SvCxcl5tm1GscwCxcl5tm1GscwCxcl5tm1Gscw
• abnormal neutrophil physiology_Cxcl5<tm1Gscw>/Cxcl5<tm1Gscw>
  http://metadb.riken.jp/0002463I129SvCxcl5tm1GscwCxcl5tm1GscwCxcl5tm1Gscw
• increased granulocyte number_Cxcl5<tm1Gscw>/Cxcl5<tm1Gscw>
  http://metadb.riken.jp/0000322I129SvCxcl5tm1GscwCxcl5tm1GscwCxcl5tm1Gscw
• decreased interferon-alpha secretion_Cxcl5<tm1.1Mkch>/Cxcl5<tm1.1Mkch>
  http://metadb.riken.jp/0008563B6129P2Cxcl5tm11MkchCxcl5tm11MkchCxcl5tm11MkchCxcl5tm11Mkch
• decreased susceptibility to endotoxin shock_Cxcl5<tm1Gscw>/Cxcl5<tm1Gscw>
  http://metadb.riken.jp/0008734I129SvCxcl5tm1GscwCxcl5tm1GscwCxcl5tm1Gscw
• decreased susceptibility to bacterial infection induced morbidity/mortality_Cxcl5<tm1.1Mkch>/Cxcl5<tm1.1Mkch>
  http://metadb.riken.jp/0009789B6129P2Cxcl5tm11MkchCxcl5tm11MkchCxcl5tm11MkchCxcl5tm11Mkch
• decreased circulating interleukin-6 level_Cxcl5<tm1Gscw>/Cxcl5<tm1Gscw>
  http://metadb.riken.jp/0008597I129SvCxcl5tm1GscwCxcl5tm1GscwCxcl5tm1Gscw
• decreased susceptibility to bacterial infection_Cxcl5<tm1Gscw>/Cxcl5<tm1Gscw>
  http://metadb.riken.jp/0002411I129SvCxcl5tm1GscwCxcl5tm1GscwCxcl5tm1Gscw
• decreased susceptibility to bacterial infection_Cxcl5<tm1.1Mkch>/Cxcl5<tm1.1Mkch>
  http://metadb.riken.jp/0002411B6129P2Cxcl5tm11MkchCxcl5tm11MkchCxcl5tm11MkchCxcl5tm11Mkch

class

http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/variant_of

• Cxcl5<tm1Gscw>
  http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/MGI:4819800
• Cxcl5<em1Krb>
  http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/MGI:5800577
• Cxcl5<tm1.1Mkch>
  http://metadb.riken.jp/db/mgi_rdf/MGI:5565192

トランスクリプトームデータ

http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/mgiGene

• CD17361
  http://metadb.riken.jp/db/BrainTx/TranscriptomeData/CD17361

Allele analyzed in IMPC

http://metadb.riken.jp/db/bioresource_schema/brs_variantOf

• Cxcl5<em1(IMPC)KMPC>
  http://metadb.riken.jp/db/IMPC_RDF/Allele/NULL_E94EBE7F9

解析対象遺伝子型

http://metadb.riken.jp/db/bioresource_schema/brs_ofGene

• Cxcl5<em1(IMPC)KMPC>/Cxcl5<em1(IMPC)KMPC>
  http://metadb.riken.jp/db/IMPC_RDF/Genotype/Cxcl5_em1(IMPC)KMPC-Cxcl5_em1(IMPC)KMPC

発現マップ

http://vibrism.neuroinf.jp/dev/201509/rdf/mgiGene

• ExpressionMap(C57BL/6J,3week,male):Cg005360
  http://vibrism.neuroinf.jp/dev/201509/rdf/ExpressionMap/C57BL_6J_3week_male/Cg005360
• ExpressionMap(C57BL/6J,8week,male):Cx126075
  http://vibrism.neuroinf.jp/dev/201509/rdf/ExpressionMap/C57BL_6J_8week_male/Cx126075
• ExpressionMap(C57BL/6J,7day,male):Cf018630
  http://vibrism.neuroinf.jp/dev/201509/rdf/ExpressionMap/C57BL_6J_7day_male/Cf018630
• ExpressionMap(C57BL/6J,3day,male):Ce017352
  http://vibrism.neuroinf.jp/dev/201509/rdf/ExpressionMap/C57BL_6J_3day_male/Ce017352