refTSS メタデータベース
マウス TATAボックス アノテーション 1
マウス TATAボックス アノテーション 2
mm_100009.1
http://metadb.riken.jp/refTSS/MouseTATAAnnotation/mm_100009.1
mm_100009.1(マウス TATAボックス アノテーション 1)
mm_100009.1(マウス TATAボックス アノテーション 2)
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mm_100009.1
マウス TATAボックス アノテーション 1
名称
http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#label
mm_100009.1
refTSS 識別子
http://purl.org/dc/terms/identifier
mm_100009.1
染色体
http://metadb.riken.jp/chromosome
chr11
TATAボックス 開始点
http://biohackathon.org/resouce/faldo#start
114852087
TATAボックス 終了点
http://biohackathon.org/resouce/faldo#end
114852287
ゲノム鎖
http://metadb.riken.jp/genomeStrand
+
ピークスコア
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1
focus ratio / region size
http://metadb.riken.jp/focusRatioPerRegionSize
アノテーション
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詳細アノテーション
http://metadb.riken.jp/detailedAnnotation
TSSまでの距離
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157
近傍プロモーター 識別子
http://metadb.riken.jp/nearestPromoterID
NM_147217
近傍 Entrez 識別子
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70355
近傍 UniGene
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Mm.242413
近傍 RefSeq
http://metadb.riken.jp/nearestRefSeq
NM_147217
近傍 Ensembl
http://metadb.riken.jp/nearestEnsembl
ENSMUSG00000051043
遺伝子名
http://metadb.riken.jp/geneName
Gprc5c
遺伝子別名
http://metadb.riken.jp/geneAlias
3200002M13Rik
Raig3
1110028I06Rik
遺伝子の説明
http://metadb.riken.jp/geneDescription
G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C
遺伝子タイプ
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protein-coding
CpG coverage
http://metadb.riken.jp/cpgCoverage
0.09
GC含量
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0.741294
マウス refTSS 2
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mm_100009.1
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mm_100009.1
マウス TATAボックス アノテーション 2
名称
http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#label
mm_100009.1
refTSS 識別子
http://purl.org/dc/terms/identifier
mm_100009.1
染色体
http://metadb.riken.jp/chromosome
chr11
TATAボックス 開始点
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114852087
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ゲノム鎖
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+
ピークスコア
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1
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アノテーション
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詳細アノテーション
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近傍 UniGene
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遺伝子別名
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遺伝子の説明
http://metadb.riken.jp/geneDescription
G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C
遺伝子タイプ
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CpG coverage
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GC含量
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マウス refTSS 2
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mm_100009.1
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